Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd1Q01822 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd1Q01822 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd1Q01822 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd1Q01822 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms