Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23aQ01405 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23aQ01405 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec23aQ01405 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms