Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SelpQ01102 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SelpQ01102 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SelpQ01102 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SelpQ01102 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SelpQ01102 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SelpQ01102 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SelpQ01102 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms