Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2cQ01098 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grin2cQ01098 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2cQ01098 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms