Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pde1bQ01065 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pde1bQ01065 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pde1bQ01065 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms