Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gjb2Q00977 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gjb2Q00977 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gjb2Q00977 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms