Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VegfaQ00731 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VegfaQ00731 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VegfaQ00731 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms