Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GabpaQ00422 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabpaQ00422 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GabpaQ00422 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabpaQ00422 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms