Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp11aP98197 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp11aP98197 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp11aP98197 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp11aP98197 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms