Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Scn1bP97952 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn1bP97952 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scn1bP97952 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scn1bP97952 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scn1bP97952 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms