Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nbr1P97432 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nbr1P97432 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nbr1P97432 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms