Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec1P97353 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec1P97353 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec1P97353 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec1P97353 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec1P97353 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec1P97353 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec1P97353 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec1P97353 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec1P97353 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sec1P97353 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec1P97353 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms