Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhodP97348 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RhodP97348 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RhodP97348 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhodP97348 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhodP97348 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhodP97348 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhodP97348 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RhodP97348 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhodP97348 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhodP97348 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RhodP97348 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhodP97348 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhodP97348 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhodP97348 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RhodP97348 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RhodP97348 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RhodP97348 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhodP97348 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhodP97348 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhodP97348 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RhodP97348 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RhodP97348 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RhodP97348 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RhodP97348 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhodP97348 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RhodP97348 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhodP97348 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RhodP97348 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhodP97348 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RhodP97348 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RhodP97348 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhodP97348 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhodP97348 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhodP97348 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RhodP97348 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RhodP97348 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RhodP97348 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RhodP97348 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RhodP97348 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RhodP97348 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhodP97348 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhodP97348 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms