Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubg1P83887 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubg1P83887 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubg1P83887 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms