Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TgfbiP82198 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TgfbiP82198 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TgfbiP82198 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TgfbiP82198 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TgfbiP82198 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TgfbiP82198 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TgfbiP82198 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TgfbiP82198 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TgfbiP82198 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TgfbiP82198 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TgfbiP82198 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TgfbiP82198 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TgfbiP82198 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TgfbiP82198 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TgfbiP82198 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms