Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr1bP70700 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1bP70700 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr1bP70700 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr1bP70700 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms