Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctps1P70698 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctps1P70698 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctps1P70698 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms