Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ufd1P70362 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ufd1P70362 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufd1P70362 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms