Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frat1P70339 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frat1P70339 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frat1P70339 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frat1P70339 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frat1P70339 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frat1P70339 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frat1P70339 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frat1P70339 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Frat1P70339 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frat1P70339 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms