Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gfi1P70338 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gfi1P70338 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gfi1P70338 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms