Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp7P70280 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp7P70280 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp7P70280 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vamp7P70280 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms