Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NficP70255 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NficP70255 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NficP70255 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NficP70255 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NficP70255 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NficP70255 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NficP70255 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NficP70255 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NficP70255 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NficP70255 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NficP70255 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NficP70255 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NficP70255 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NficP70255 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NficP70255 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NficP70255 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NficP70255 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NficP70255 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NficP70255 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NficP70255 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NficP70255 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NficP70255 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NficP70255 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NficP70255 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NficP70255 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NficP70255 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NficP70255 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NficP70255 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NficP70255 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NficP70255 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NficP70255 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NficP70255 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NficP70255 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NficP70255 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NficP70255 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NficP70255 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NficP70255 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NficP70255 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NficP70255 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms