Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf6P70196 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf6P70196 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf6P70196 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf6P70196 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf6P70196 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf6P70196 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Traf6P70196 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms