Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
Abcc9P70170 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Abcc9P70170 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Abcc9P70170 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
Abcc9P70170 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Abcc9P70170 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
Abcc9P70170 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC46.28■■■■■ 5
Abcc9P70170 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Abcc9P70170 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Abcc9P70170 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Abcc9P70170 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Abcc9P70170 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Abcc9P70170 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Abcc9P70170 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Abcc9P70170 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC46.19■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
Abcc9P70170 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc9P70170 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Abcc9P70170 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms