Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crip1P63254 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Crip1P63254 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crip1P63254 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Crip1P63254 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Crip1P63254 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Crip1P63254 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Crip1P63254 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Crip1P63254 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms