Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SnrpnP63163 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SnrpnP63163 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SnrpnP63163 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SnrpnP63163 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SnrpnP63163 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms