Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Gabrb3P63080 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabrb3P63080 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabrb3P63080 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabrb3P63080 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.6 ms