Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp3P63024 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp3P63024 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp3P63024 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms