Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps3P62908 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps3P62908 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps3P62908 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps3P62908 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms