Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabra1P62812 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabra1P62812 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabra1P62812 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gabra1P62812 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms