Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsnl1P62761 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vsnl1P62761 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsnl1P62761 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsnl1P62761 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vsnl1P62761 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms