Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arf6P62331 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf6P62331 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arf6P62331 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms