Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc5P62196 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc5P62196 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psmc5P62196 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmc5P62196 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc5P62196 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc5P62196 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms