Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tspan5P62080 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan5P62080 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms