Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrch1P62046 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrch1P62046 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrch1P62046 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrch1P62046 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrch1P62046 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms