Protein–RNA interactions for Protein: P61963

Dcaf7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf7P61963 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcaf7P61963 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcaf7P61963 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcaf7P61963 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dcaf7P61963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms