Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme3P61290 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psme3P61290 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psme3P61290 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Psme3P61290 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme3P61290 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Psme3P61290 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psme3P61290 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psme3P61290 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme3P61290 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psme3P61290 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms