Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arf3P61205 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf3P61205 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf3P61205 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arf3P61205 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arf3P61205 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf3P61205 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf3P61205 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf3P61205 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms