Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppfia3P60469 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfia3P60469 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia3P60469 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia3P60469 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms