Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vps33bP59016 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Vps33bP59016 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vps33bP59016 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Vps33bP59016 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vps33bP59016 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186 ms