Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctdsp1P58466 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctdsp1P58466 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp1P58466 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp1P58466 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms