Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf16P58334 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf16P58334 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf16P58334 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf16P58334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf16P58334 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf16P58334 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf16P58334 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf16P58334 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms