Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snrpa1P57784 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snrpa1P57784 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snrpa1P57784 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snrpa1P57784 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snrpa1P57784 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms