Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn4P57780 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn4P57780 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn4P57780 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn4P57780 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn4P57780 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn4P57780 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn4P57780 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn4P57780 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn4P57780 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn4P57780 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn4P57780 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms