Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmchP56942 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmchP56942 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmchP56942 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmchP56942 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PmchP56942 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmchP56942 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmchP56942 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmchP56942 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmchP56942 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PmchP56942 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmchP56942 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmchP56942 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmchP56942 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PmchP56942 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmchP56942 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmchP56942 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmchP56942 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmchP56942 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PmchP56942 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PmchP56942 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PmchP56942 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PmchP56942 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PmchP56942 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PmchP56942 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PmchP56942 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmchP56942 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmchP56942 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmchP56942 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmchP56942 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PmchP56942 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PmchP56942 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PmchP56942 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PmchP56942 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PmchP56942 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms