Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsc2P56916 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsc2P56916 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gsc2P56916 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms