Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsc1P55849 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsc1P55849 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsc1P55849 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsc1P55849 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms