Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NcanP55066 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcanP55066 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcanP55066 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcanP55066 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NcanP55066 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NcanP55066 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NcanP55066 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NcanP55066 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NcanP55066 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NcanP55066 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NcanP55066 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NcanP55066 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcanP55066 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcanP55066 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NcanP55066 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NcanP55066 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NcanP55066 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NcanP55066 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NcanP55066 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NcanP55066 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NcanP55066 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NcanP55066 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NcanP55066 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NcanP55066 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcanP55066 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcanP55066 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcanP55066 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NcanP55066 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcanP55066 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcanP55066 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcanP55066 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NcanP55066 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NcanP55066 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NcanP55066 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NcanP55066 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NcanP55066 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NcanP55066 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcanP55066 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NcanP55066 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NcanP55066 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NcanP55066 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcanP55066 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcanP55066 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NcanP55066 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NcanP55066 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NcanP55066 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NcanP55066 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NcanP55066 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NcanP55066 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NcanP55066 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NcanP55066 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcanP55066 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcanP55066 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcanP55066 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NcanP55066 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NcanP55066 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NcanP55066 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NcanP55066 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NcanP55066 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NcanP55066 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms