Protein–RNA interactions for Protein: P54869

Hmgcs2, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcs2P54869 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hmgcs2P54869 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmgcs2P54869 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmgcs2P54869 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgcs2P54869 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgcs2P54869 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms