Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NrlP54846 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrlP54846 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrlP54846 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrlP54846 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrlP54846 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NrlP54846 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrlP54846 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NrlP54846 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrlP54846 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NrlP54846 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrlP54846 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrlP54846 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrlP54846 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrlP54846 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrlP54846 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrlP54846 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrlP54846 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrlP54846 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrlP54846 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrlP54846 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrlP54846 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrlP54846 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrlP54846 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NrlP54846 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrlP54846 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NrlP54846 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrlP54846 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrlP54846 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrlP54846 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NrlP54846 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NrlP54846 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrlP54846 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrlP54846 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NrlP54846 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrlP54846 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrlP54846 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrlP54846 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrlP54846 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NrlP54846 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrlP54846 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrlP54846 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrlP54846 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NrlP54846 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrlP54846 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrlP54846 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrlP54846 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NrlP54846 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrlP54846 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrlP54846 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrlP54846 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NrlP54846 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms